In this work, we demonstrate the offline FPGA realization of both recurrent and feedforward neural network (NN)-based equalizers for nonlinearity compensation in coherent optical transmission systems. First, we present a realization pipeline showing the conversion of the models from Python libraries to the FPGA chip synthesis and implementation. Then, we review the main alternatives for the hardware implementation of nonlinear activation functions. The main results are divided into three parts: a performance comparison, an analysis of how activation functions are implemented, and a report on the complexity of the hardware. The performance in Q-factor is presented for the cases of bidirectional long-short-term memory coupled with convolutional NN (biLSTM + CNN) equalizer, CNN equalizer, and standard 1-StpS digital back-propagation (DBP) for the simulation and experiment propagation of a single channel dual-polarization (SC-DP) 16QAM at 34 GBd along 17x70km of LEAF. The biLSTM+CNN equalizer provides a similar result to DBP and a 1.7 dB Q-factor gain compared with the chromatic dispersion compensation baseline in the experimental dataset. After that, we assess the Q-factor and the impact of hardware utilization when approximating the activation functions of NN using Taylor series, piecewise linear, and look-up table (LUT) approximations. We also show how to mitigate the approximation errors with extra training and provide some insights into possible gradient problems in the LUT approximation. Finally, to evaluate the complexity of hardware implementation to achieve 400G throughput, fixed-point NN-based equalizers with approximated activation functions are developed and implemented in an FPGA.
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To circumvent the non-parallelizability of recurrent neural network-based equalizers, we propose knowledge distillation to recast the RNN into a parallelizable feedforward structure. The latter shows 38\% latency decrease, while impacting the Q-factor by only 0.5dB.
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Despite the impact of psychiatric disorders on clinical health, early-stage diagnosis remains a challenge. Machine learning studies have shown that classifiers tend to be overly narrow in the diagnosis prediction task. The overlap between conditions leads to high heterogeneity among participants that is not adequately captured by classification models. To address this issue, normative approaches have surged as an alternative method. By using a generative model to learn the distribution of healthy brain data patterns, we can identify the presence of pathologies as deviations or outliers from the distribution learned by the model. In particular, deep generative models showed great results as normative models to identify neurological lesions in the brain. However, unlike most neurological lesions, psychiatric disorders present subtle changes widespread in several brain regions, making these alterations challenging to identify. In this work, we evaluate the performance of transformer-based normative models to detect subtle brain changes expressed in adolescents and young adults. We trained our model on 3D MRI scans of neurotypical individuals (N=1,765). Then, we obtained the likelihood of neurotypical controls and psychiatric patients with early-stage schizophrenia from an independent dataset (N=93) from the Human Connectome Project. Using the predicted likelihood of the scans as a proxy for a normative score, we obtained an AUROC of 0.82 when assessing the difference between controls and individuals with early-stage schizophrenia. Our approach surpassed recent normative methods based on brain age and Gaussian Process, showing the promising use of deep generative models to help in individualised analyses.
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深度神经网络在医学图像分析中带来了显着突破。但是,由于其渴望数据的性质,医学成像项目中适度的数据集大小可能会阻碍其全部潜力。生成合成数据提供了一种有希望的替代方案,可以补充培训数据集并进行更大范围的医学图像研究。最近,扩散模型通过产生逼真的合成图像引起了计算机视觉社区的注意。在这项研究中,我们使用潜在扩散模型探索从高分辨率3D脑图像中生成合成图像。我们使用来自英国生物银行数据集的T1W MRI图像(n = 31,740)来训练我们的模型,以了解脑图像的概率分布,该脑图像以协变量为基础,例如年龄,性别和大脑结构量。我们发现我们的模型创建了现实的数据,并且可以使用条件变量有效地控制数据生成。除此之外,我们创建了一个带有100,000次脑图像的合成数据集,并使科学界公开使用。
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在本文中,提出了一种新的方法,该方法允许基于神经网络(NN)均衡器的低复杂性发展,以缓解高速相干光学传输系统中的损伤。在这项工作中,我们提供了已应用于馈电和经常性NN设计的各种深层模型压缩方法的全面描述和比较。此外,我们评估了这些策略对每个NN均衡器的性能的影响。考虑量化,重量聚类,修剪和其他用于模型压缩的尖端策略。在这项工作中,我们提出并评估贝叶斯优化辅助压缩,其中选择了压缩的超参数以同时降低复杂性并提高性能。总之,通过使用模拟和实验数据来评估每种压缩方法的复杂性及其性能之间的权衡,以完成分析。通过利用最佳压缩方法,我们表明可以设计基于NN的均衡器,该均衡器比传统的数字背部传播(DBP)均衡器具有更好的性能,并且只有一个步骤。这是通过减少使用加权聚类和修剪算法后在NN均衡器中使用的乘数数量来完成的。此外,我们证明了基于NN的均衡器也可以实现卓越的性能,同时仍然保持与完整的电子色色散补偿块相同的复杂性。我们通过强调开放问题和现有挑战以及未来的研究方向来结束分析。
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使用机器学习算法从未标记的文本中提取知识可能很复杂。文档分类和信息检索是两个应用程序,可以从无监督的学习(例如文本聚类和主题建模)中受益,包括探索性数据分析。但是,无监督的学习范式提出了可重复性问题。初始化可能会导致可变性,具体取决于机器学习算法。此外,关于群集几何形状,扭曲可能会产生误导。在原因中,异常值和异常的存在可能是决定因素。尽管初始化和异常问题与文本群集和主题建模相关,但作者并未找到对它们的深入分析。这项调查提供了这些亚地区的系统文献综述(2011-2022),并提出了共同的术语,因为类似的程序具有不同的术语。作者描述了研究机会,趋势和开放问题。附录总结了与审查的作品直接或间接相关的文本矢量化,分解和聚类算法的理论背景。
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FPGA中首次实施了针对非线性补偿的经常性和前馈神经网络均衡器,其复杂度与分散均衡器的复杂度相当。我们证明,基于NN的均衡器可以胜过1个速度的DBP。
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癌症是一种复杂的疾病,具有重大的社会和经济影响。高通量分子测定的进步以及进行高质量多摩斯测量的成本降低,通过机器学习促进了见解。先前的研究表明,使用多个OMIC预测生存和分层癌症患者的希望。在本文中,我们开发了一种有监督的自动编码器(SAE)模型,用于基于生存的多摩变集成,该模型在以前的工作中改进,并报告一种具体的监督自动编码器模型(CSAE),该模型(CSAE)也使用功能选择来共同重建输入功能。作为预测生存。我们的实验表明,我们的模型表现优于或与一些最常用的基线相提并论,同时提供更好的生存分离(SAE)或更容易解释(CSAE)。我们还对我们的模型进行了特征选择稳定性分析,并注意到与通常与生存有关的特征存在幂律关系。该项目的代码可在以下网址获得:https://github.com/phcavelar/coxae
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深层生成模型已成为检测数据中任意异常的有前途的工具,并分配了手动标记的必要性。最近,自回旋变压器在医学成像中取得了最先进的性能。但是,这些模型仍然具有一些内在的弱点,例如需要将图像建模为1D序列,在采样过程中误差的积累以及与变压器相关的显着推理时间。去核扩散概率模型是一类非自动回旋生成模型,最近显示出可以在计算机视觉中产生出色的样品(超过生成的对抗网络),并实现与变压器具有竞争力同时具有快速推理时间的对数可能性。扩散模型可以应用于自动编码器学到的潜在表示,使其易于扩展,并适用于高维数据(例如医学图像)的出色候选者。在这里,我们提出了一种基于扩散模型的方法,以检测和分段脑成像中的异常。通过在健康数据上训练模型,然后探索其在马尔可夫链上的扩散和反向步骤,我们可以识别潜在空间中的异常区域,因此可以确定像素空间中的异常情况。我们的扩散模型与一系列具有2D CT和MRI数据的实验相比,具有竞争性能,涉及合成和实际病理病变,推理时间大大减少,从而使它们的用法在临床上可行。
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时间序列代表一组随时间收集的观察结果。通常,这些观察结果以均匀的采样频率(例如,每日)捕获。当在不均匀的时间间隔中观察到数据点时,时间序列被称为不规则或间歇性。在这种情况下,最常见的解决方案是重建时间序列以使其定期,从而消除其间歇性。我们假设,在不规则时间序列中,收集每个观察的时间可能有助于总结数据的动态并提高预测性能。我们通过开发一种新颖的自动特征工程框架来研究这个想法,该框架专注于从该角度来提取信息,即,收集每个实例时。我们研究了这些信息的有价值如何通过将其集成在时间序列预测工作流程中,并调查它如何比较或补充定期时间序列预测的最先进方法。最后,我们通过提供一种新颖的框架,该框架可以从前忽略的角度处理时间序列的特征工程。我们表明,我们的方法有可能进一步提取有关时间序列的更多信息,这些信息显着提高了预测性能。
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